Huyện Ea Kar được thành lập vào ngày 13 tháng 9 năm 1986 theo Quyết định 108-HĐBT của Hội đồng Bộ trưởng trên cơ sở tách xã Ea Kar thuộc huyện Krông Pắc; thị trấn Ea Knốp và 2 xã: Cư Jiang, Ea Păn thuộc huyện M'Đrắk.[1]

Sau khi thành lập, huyện Ea Kar có thị trấn Ea Knốp và 3 xã: Cư Jiang, Ea Kar, Ea Păn. Huyện lỵ đặt tại xã Ea Kar.

Trong giai đoạn 1988-1994, huyện giải thể xã Ea Kar và thành lập 9 đơn vị hành chính là thị trấn Ea Kar và các xã: Cư Huê, Cư Ni, Ea Đar, Ea Kmút, Ea Ô, Ea Sô, Ea Tíh, Xuân Phú.

Ngày 31 tháng 12 năm 2002, chia xã Cư Jiang thành 2 xã: Cư Bông và Cư Yang.[4]

Ngày 23 tháng 3 năm 2005, Chính phủ ban hành Nghị định 40/2005/NĐ-CP[5]. Theo đó:

• Chia xã Ea Păn thành 2 xã Cư Prông và Ea Păl
• Thành lập xã Cư Elang trên cơ sở 8.024 ha diện tích tự nhiên và 4.315 người của xã Ea Ô.

Ngày 27 tháng 8 năm 2007, thành lập xã Ea Sar trên cơ sở 3.677 ha diện tích tự nhiên và 4.739 người của xã Ea Sô; 1.962 ha diện tích tự nhiên và 1.772 người của xã Xuân Phú.[6]

Huyện Ea Kar có 2 thị trấn và 14 xã như hiện nay.

Ngày 19 tháng 11 năm 2008, thị trấn Ea Kar được công nhận là đô thị loại IV.